Das kann verschiedene Gründe haben. Zum Einen weiß ich nicht definitiv, ob wirklich alle Truhen in allen Instanzen zu jeder Zeit die gleiche Respawnzeit haben, zum Anderen weiß ich jedoch, daß die Respawnzeit unter anderem von der Gesamtanzahl der zu dem Zeitpunkt gespawnten Truhen in der Instanz abhängt.
Soll heißen, es gibt nie alle möglichen Truhen in einer Instanz gleichzeitig. Wenn man also Pech hat und neben einem Truhenstandort campt, respawnt die nie, sofern momentan die maximale Anzahl an Truhen in dieser Instanz erreicht ist.

Edit: oh, und es kann natürlich genauso gut sein, daß eine Truhe respawnt, aber nicht an der selben Stelle.
Edit2: weshalb sich zum Testen Soloinstanzen am besten eignen.